Mikrobiota i mikrobiom
Na początek warto przypomnieć sobie podstawowe pojęcia związane z naszym ekosystemem jelitowym. Mikrobiota to ogół mikroorganizmów zasiedlających nasze jelita, czyli bakterie, archeony oraz grzyby. Z kolei mikrobiom to niejako zestaw genów tych wszystkich mikroorganizmów [1]. U zdrowych ludzi skład mikrobioty jest zróżnicowany. Przeważają szczepy umożliwiające utrzymanie zdrowia przy zmieniających się warunkach zewnętrznych, w tym różnych zdarzeniach związanych ze stresem i stanem zapalnym. Z kolei w warunkach dysbiozy mikrobiota jest mniej urozmaicona, a ilość bakterii komensalnych zbyt mała, żeby umożliwić utrzymanie wewnętrznej homeostazy. Nieprawidłowości w zakresie ekosystemu jelitowego mogą prowadzić do rozwoju takich chorób, jak otyłość, cukrzyca, marskość wątroby czy nieswoiste choroby zapalne jelit [1]. Możliwości dzisiejszej diagnostyki i medycyny umożliwiają traktowanie mikrobiomu i mikrobioty jako swoistego biomarkera umożliwiającego wdrożenie odpowiednich strategii terapeutycznych. Indywidualne uwarunkowania związane z mikrobiotą człowieka mogą być nawet odpowiedzialne za efektywność wdrożonej farmakoterapii przykładowo w leczeniu chorób nowotworowych. Co ciekawe, peptydy bakteryjne naszej mikrobioty mogą interferować z komórkami nowotworowymi, wpływając na procesy sygnalizacji, a finalnie też na ich namnażanie. Co więcej, skład mikrobioty może determinować aktywność niektórych kompleksów działających jako czynniki transkrypcyjne. I tak poszczególne bakterie mogą wpływać na aktywność jądrowego czynnika transkrypcyjnego NFkappaB, który jest z kolei regulatorem procesów zapalnych i kancerogenezy. Proporcje poszczególnych gatunków bakterii mogą determin...