Kiedy badanie mikrobiomu jest przydatne i jak działa?

Co to jest mikrobiom?

Mikrobiom jelitowy odnosi się do ogółu wszystkich mikroorganizmów występujących w jelicie. Większość stanowią bakterie, ale wirusy i grzyby żyją także m.in. w naszych narządach trawiennych.

Czy to źle?

Zupełnie nie! Drobni mieszkańcy naszych jelit są niezbędni dla naszego zdrowia i wykonują ważne zadania: pomagają nam utrzymać zdrowe jelita, lepiej wykorzystywać spożywaną żywność, wytwarzać witaminy i zmniejszać stany zapalne w organizmie.

Większość drobnoustrojów znajduje się w jelicie grubym, ponieważ ma tam idealne warunki do ich wzrostu. Oprócz jelit mamy także własny mikrobiom na skórze, w jamie ustnej i drogach oddechowych.

Jak działają badania mikrobiomu?

Florę jelitową bada się na podstawie próbki kału . Próbki kału można łatwo pobrać i zawierają szczególnie dużą liczbę mikroorganizmów. Analiza koncentruje się zwykle na bakteriach, ponieważ średnio około 95% mikrobiomu jelitowego składa się z bakterii.

Aby móc zarejestrować ogólny stan bakterii w jelicie, jakie organizmy występują i w jakim stosunku do siebie, stosuje się tzw. sekwencjonowanie. Podczas sekwencjonowania DNA bakterii jest odczytywane w laboratorium, a następnie analizowane. Dzięki temu można określić, jakie bakterie występują, w jakiej ilości i jaką funkcję pełnią.

Sekwencjonowanie nowej generacji jest najpowszechniejszą metodą sekwencjonowania, w ramach której można dokonać rozróżnienia pomiędzy:

Sekwencjonowanie amplikonu:

Sekwencjonowanie amplikonu bada specyficzny odcinek genu, gen 16S rRNA w bakteriach. Ta sekcja genów jest szczególnie odpowiednia do wydajnej i niezawodnej analizy bakterii.

Korzyść: Specjalizując się tylko w jednej konkretnej sekcji genu, tworzone są mniejsze ilości danych. Dzięki temu metoda jest bardziej czasochłonna i tańsza, a analizowane przekroje można zbadać dokładniej i głębiej.

Wada: mniej informacji o całym genomie bakterii. Utrudnia to na przykład rozróżnienie bardzo blisko spokrewnionych gatunków.

Sekwencjonowanie metagenomiczne całego genomu:

Sekwencjonowanie typu shotgun charakteryzuje się tym, że analizuje się cały genom bakterii, a nie tylko jego fragment.

Zaleta: szersza informacja o bakteriach.

Wada: Ze względu na większą ilość danych poszczególne sekcje są analizowane mniej szczegółowo. Do badania mikrobiomu jelitowego nie jest również konieczne rozbicie całego materiału genetycznego.

Po sekwencjonowaniu obie metody sekwencjonowania wykorzystują algorytmy bioinformatyczne do generowania wyników poprzez ocenę uzyskanych danych, przeprowadzanie pewnych obliczeń i powiązanie z określonymi schorzeniami.

Mikrobiom jelitowy analizuje się na podstawie próbki kału.
Jak wygląda proces badania mikrobiomu?

 Badanie flory jelitowej zwykle składa się z następujących etapów:

1. Zamawianie lub odbieranie badania jelitowego
2. Pobranie próbek i wysyłka zwrotna
3. Wypełnienie ankiety
4. Sekwencjonowanie laboratorium i generowanie raportów
5. Odbiór wyników

Zamawianie zestawu testowego

Większość badań mikrobiomu jelitowego, takich jak test mikrobiomu myBioma , można wygodnie zamówić online i dotrzeć do Ciebie pocztą w ciągu kilku najbliższych dni. Zestawy testowe dostępne są także w wybranych aptekach, u lekarzy czy dietetyków.

Pobieranie próbek i szybka wysyłka zwrotna

Do badania mikrobiomu pobierana jest niewielka próbka kału, którą rozpuszcza się w probówce dołączonej do zestawu testowego. Wszystko jest dobrze zapieczętowane, zapakowane i wysłane do laboratorium. Probówka zawiera płyn, który konserwuje próbkę kału podczas transportu powrotnego i stabilizuje próbkę.

Wypełnienie ankiety

W przypadku większości testów zalecane jest wypełnienie kwestionariusza online. Zwykle obejmuje to pytania istotne dla oceny lub mogące mieć wpływ na mikrobiom.

Analiza w laboratorium i generowanie raportu

Gdy próbka dotrze do laboratorium, jest przygotowywana do analizy, aby można było zsekwencjonować DNA bakterii. Sekwencjonowanie rozkłada małe pojedyncze fragmenty DNA. Umożliwia to identyfikację bakterii i jej funkcji.

Po zakończeniu analizy uzyskane dane są dalej przetwarzane z wykorzystaniem bioinformatyki. W oparciu o najnowsze odkrycia naukowe, wyniki są obliczane, interpretowane i tworzony jest raport z wyników.

Odbiór wyników

Wynikiem badania mikrobiomu jest zazwyczaj kompleksowy raport analityczny. Zawiera wyniki badań laboratoryjnych, szczegółowe informacje o aktualnym stanie mikrobiomu jelitowego oraz wyjaśnia, co to oznacza dla Twojego zdrowia. W zależności od dostawcy raport zawiera również zalecenia dotyczące ulepszenia lub optymalizacji składu mikrobiomu.

Zawartość zestawu testowego myBioma dla nieskomplikowanego procesu.
Ile kosztuje badanie mikrobiomu i którzy dostawcy są tam dostępni?

Koszt badania mikrobiomu może się nieco różnić w zależności od dostawcy, zakresu i kraju. W Europie większość testów kosztuje od 100 do 400 euro. Analizy i badania bez zaleceń żywieniowych i sugestii usprawnień są zazwyczaj tańsze.

Przyszłe perspektywy badań mikrobiomów

Jak twierdzi dr. Barbara Sladek, biochemiczka z Uniwersytetu Oksfordzkiego w Wielkiej Brytanii, biolog molekularny oraz założycielka start-upu zajmującego się testami mikrobiomu myBioma: „Badania nad mikrobiomem otwierają obiecujące perspektywy medycyny spersonalizowanej, na przykład poprzez indywidualnie dostosowane odżywianie, probiotyki i inne interwencje oparte na mikrobiomie. Oprócz klasycznych danych na temat zdrowia, biomarkery mikrobiomu będą mogły wkrótce zostać uwzględnione w opracowywaniu spersonalizowanych strategii żywieniowych. Pierwsze zastosowania do kontroli poziomu cukru we krwi i lipidów we krwi oparte na uczeniu maszynowym już przynoszą sukcesy. W przyszłości podczas leczenia zespołu jelita drażliwego pacjentów można będzie również dzielić na grupy w oparciu o konkretne objawy i czynniki związane ze stylem życia i leczyć w sposób ukierunkowany, zamiast stosować podejście „jedne rozwiązanie dla wszystkich”. Takie zastosowania mogłyby przyczynić się do wczesnego wykrywania i indywidualnego leczenia chorób takich jak cukrzyca typu 2, choroby układu krążenia, depresja , choroba Parkinsona, rak jelita grubego czy przewlekłe zapalenie jelit.”

Kiedy przydatne jest badanie mikrobiomu?

Testy mikrobiomu są często krytykowane za to, że nie dostarczają zbyt wielu informacji. Wyjaśniamy, kiedy badanie mikrobiomu faktycznie ma sens i czego można po nim realistycznie oczekiwać.

Badanie mikrobiomu ma sens, jeśli:

• Zostałeś przepisany przez lekarza lub dietetyka.
• Chcesz wiedzieć jaki jest stan zdrowia i skład Twojego mikrobiomu?
• Chcesz dowiedzieć się, jak różnorodny i zróżnicowany jest Twój mikrobiom.
• Od dłuższego czasu cierpisz na niejasne problemy trawienne lub jelitowe.
• Czy ciekawi Cię, jak Twój mikrobiom może wpływać na inne obszary Twojego ciała, takie jak układ odpornościowy , skóra lub stany zapalne?
• Szukasz zaleceń dotyczących diety i stylu życia przyjaznego jelitom ?
• Chcesz obserwować zmiany w mikrobiomie na przestrzeni czasu, aby zmierzyć skuteczność zmian w diecie lub stylu życia.
• Chcesz wcześnie zidentyfikować ryzyko niektórych chorób.
   

Badania mikrobiomu – czego nie potrafią:

• Stawiania diagnozy. Test nie diagnozuje, ale dostarcza cennych informacji na temat powiązań między składem mikrobiomu a określonymi schorzeniami lub chorobami.
• Nie ma substytutu leczenia. Jeśli masz jakiekolwiek objawy, zdecydowanie powinieneś skonsultować się z lekarzem lub dietetykiem.
• Uzdrawiać. Nie ma czegoś takiego jak cudowna pigułka czy cudowne lekarstwo na poprawę samopoczucia. Badania mikrobiomu mogą jedynie pokazać, które aspekty można poprawić oraz dostarczyć rekomendacji i inspiracji, jak dążyć do poprawy.
   

Testowanie mikrobiomu cierpi na brak standaryzacji

Ponieważ badania nad mikrobiomami są stosunkowo nowym obszarem badawczym, w rzeczywistości brakuje pewnej standaryzacji w zakresie pobierania i analizy próbek. Może to utrudniać porównywanie wyników uzyskanych od różnych dostawców. Dowiedz się wcześniej, jaki zakres i treść otrzymujesz od różnych dostawców. W przypadku testu uzupełniającego zaleca się pozostanie u pierwotnego dostawcy, aby zobaczyć postępy i umożliwić bezpośrednie porównanie.

Zwróć także uwagę na certyfikaty, takie jak certyfikaty ISO, które oznaczają wysoką jakość i sprawdzone procesy.

Znaczenie badań jest ograniczone krótkotrwałymi wahaniami mikrobiomu

Głównym celem badania mikrobiomu jest zapewnienie wszechstronnego wglądu w stan i skład mikrobiomu. Podobnie jak morfologia krwi, test zapewnia migawkę, ponieważ mikrobiom stale się zmienia pod wpływem diety, stylu życia, ćwiczeń fizycznych , chorób i leków.

Niemniej jednak migawka może również dostarczyć cennych informacji i ujawnić aktualny stan zdrowia jelit. Pewien podstawowy mikrobiom nie podlega codziennym wahaniom, a jedynie zmienia się na skutek długotrwałych zmian w diecie.

Zaleca się ponowne przetestowanie po około 3 do 6 miesiącach, aby zobaczyć postęp i zmiany.

Wyniki badań często nie dają jednoznacznych zaleceń terapeutycznych

Przed zakupem badania mikrobiomu dowiedz się, w jakim stopniu badanie uwzględnia zalecenia terapeutyczne. Niektóre testy, takie jak test mikrobiomu myBioma, oferują zalecenia dotyczące diety i stylu życia lub istnieje możliwość zasięgnięcia porady dietetyka.

Ponieważ problemy zdrowotne związane z mikrobiomem są często bardzo indywidualne, zaleca się, aby wyniki badań traktować jako punkt wyjścia: odzwierciedlają one aktualny stan i wskazują wstępne możliwości działania. W przypadku konkretnych i indywidualnie dostosowanych interwencji wskazane jest zwrócenie się o pomoc do dietetyka lub lekarza.

Wyniki badań pomagają także lekarzom i terapeutom w precyzyjnej ocenie aktualnego stanu pacjenta i opracowaniu na tej podstawie odpowiednich podejść terapeutycznych.

Badania mikrobiomu mogą ujawnić jedynie powiązania, a nie przyczyny

Wyniki badania pokazują, że określone bakterie są powiązane z określonym stanem zdrowia, a nie że są jednocześnie przyczyną choroby. Oznacza to, że w większości aspektów związek przyczynowo-skutkowy nie został jeszcze ostatecznie wyjaśniony.

Mikrobiom ze wszystkimi jego różnymi mikroorganizmami i funkcjami, a także interakcja mikrobiomu z organizmem ludzkim i metabolizmem jest bardzo złożona. To sprawia, że znalezienie przyczyny jest niezwykle trudne. Jednakże skojarzenia można postrzegać jako ważne wskazówki. Nawet jeśli nie wszystkie bakterie są bezpośrednio powiązane przyczynowo z chorobami, stowarzyszenia dostarczają cennych informacji na temat możliwych podejść profilaktycznych lub zindywidualizowanych terapii, które są przydatne w osobistej opiece zdrowotnej.

Marka myBioma: testy mikrobiomu umożliwiające analizę zdrowia jelit

Wizją myBioma jest poprawa jakości życia klientów i przeniesienie zdrowia jelit na nowy poziom dzięki innowacyjnym testom mikrobiomu.

Oto, co oznacza myBioma:

• Wyniki poparte naukowo.
• Standaryzowane etapy procesu – od ekstrakcji i sekwencjonowania próbek po analizę bioinformatyczną i interpretację danych.
• Cenne informacje na temat unikalnego składu i funkcjonalności bakterii jelitowych.
• Pierwsza firma na świecie posiadająca podwójny certyfikat ISO w zakresie mikrobiomu, który oznacza najwyższą jakość i niezawodność.
• Oparte na dowodach spersonalizowane zalecenia żywieniowe i dotyczące stylu życia dostosowane do Twoich indywidualnych potrzeb.
• Unikalne połączenie najnowocześniejszych metod analitycznych sekwencjonowania nowej generacji (sekwencjonowanie amplikonu 16S) jest powiązane z rosnącą bazą wiedzy na temat interakcji mikrobiomu z organizmem człowieka oraz opracowanymi wewnętrznie algorytmami bioinformatycznymi i modelami AI , aby uzyskać najdokładniejsze i najgłębsze wyniki i skojarzenia.
• Identyfikacja ponad 5000 gatunków bakterii.
• Interdyscyplinarny zespół rozwojowy składający się z ekspertów z zakresu nauk o żywieniu, medycyny, bioinformatyki i komunikacji.
   

Wszelkie informacje i szczegóły dotyczące zakresu i treści badania dostępne są na stronie myBioma: https://mybioma.com/products/kit