Probiotyki stosuje się w antybiotykoterapii, celach profilaktycznych oraz jako wspomaganie w różnych jednostkach chorobowych. Minimalna dzienna dawka terapeutyczna powinna wynosić 106–109 CFU/dzień. Jednym z lepszych źródeł probiotyków są preparaty farmaceutyczne, suplementy diety oraz żywność fermentowana. Lactobacillus rhamnosus GG to jedna z najlepiej poznanych bakterii probiotycznych, która daje najwyższą efektywność w ostrych biegunkach infekcyjnych, rotawirusowych czy poantybiotykowych.