Mikrobiota jelitowa to zbiorowisko mikroorganizmów zamieszkujących jelita, składające się głównie z bakterii i mające wpływ na wiele aspektów zdrowia człowieka. Pojawiające się publikacje naukowe jasno sugerują, że wpływ mikroorganizmów zasiedlających ciało człowieka jest istotny, a w wielu przypadkach kluczowy dla zapewnienia homeostazy i prawidłowego funkcjonowania organizmu. Poza tym, w przeciwieństwie do genów, na mikrobiotę jelitową można do pewnego stopnia wpłynąć poprzez zmianę długofalowego stylu odżywiania lub probiotykoterapię.